工業污水處理基本工藝流程包括三部分：預處理+生化處理+深度處理或消毒。污水的預處理一般是采用物理或化學的手段去除水中的雜質和部分污染物，常用的方法有格柵、沉砂池和混凝沉淀等。生化處理則可分為兩種，好氧生物法和厭氧生物法，其中采用厭氧生物處理法的污水處理工藝，后段會聯合好氧生物法以保證出水能夠達標。污水經過生化處理后，根據出水的排放標準達標排放，或者有回用需求進行深度處理并消毒，就可當回用水使用了。

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工業污水處理工程的調試工作就是使整個污水處理系統的所有設備能夠正常運行并且出水能夠達標。對于預處理和深度處理的調試主要是調節環保機械設備的加藥量和運行參數，調試所需的時間并不長。

工業污水處理工程的調試工作重要的任務是生化處理系統的調試，使生化系統培養出能夠高效分解水中污染的菌種，這個過程比較緩慢。污水處理的生化處理過程其實就是靠生長在水中以污染物為食的微生物分解污染物的過程，這個過程因為處理污水的水質不同其中生長的微生物的組成和數量也不盡相同。

一般的，采用好氧生物處理的生化池中常見的微生物有產堿桿菌屬、黃桿菌屬、芽孢桿菌屬、假單胞桿菌屬、無色桿菌屬、微桿菌屬、動膠桿菌屬、微球菌屬、氣桿菌屬、節桿菌屬、棒狀桿菌屬、叢毛單胞菌屬、桿菌屬、諾卡氏菌屬、球衣細菌屬、短桿菌屬、亞硝化單胞菌屬、蛭弧菌屬、糞大腸菌屬、貝氏硫菌屬、柄細菌屬、噬纖維菌屬等，此外還有一些真菌、原生動物和后生動物。

存在于厭氧處理系統的微生物種類比好氧處理要少得多，主要分為兩大類，即兼性好氧菌，包括產黃纖維單胞菌、淀粉芽孢梭菌、蠟狀芽孢桿菌、丙酮丁醇芽孢梭菌、琥珀酸擬桿菌等；專性厭氧菌的有脫硫弧菌屬、硝酸鹽還原細菌、脫氮硫桿菌、脫氮極毛桿菌、脫硫腸狀菌屬、產甲烷桿菌屬、產甲烷球菌屬、產甲烷吧疊球菌屬、產甲烷螺菌屬等。

對于不同水質的污水，在其中占據優勢的微生物的種類也不同，生化系統的調試過程就是通過控制進水篩選培養出能夠適應相應污水的高效菌種。

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